MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Aeropyrum pernix K1

Total Repeats: 37127

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5002	NC_000854	G	6	6	235823	235828	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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5004	NC_000854	TAC	2	6	235876	235881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14600632
5005	NC_000854	CTT	2	6	236012	236017	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14600632
5006	NC_000854	CTC	2	6	236097	236102	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14600632
5007	NC_000854	AGG	2	6	236129	236134	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14600632
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5009	NC_000854	GCCT	2	8	236177	236184	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5010	NC_000854	AG	3	6	236198	236203	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5011	NC_000854	AGG	2	6	236253	236258	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5012	NC_000854	AGG	2	6	236260	236265	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5013	NC_000854	GAG	2	6	236268	236273	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5014	NC_000854	G	6	6	236304	236309	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5015	NC_000854	TGT	2	6	236311	236316	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5016	NC_000854	CCG	2	6	236324	236329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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5021	NC_000854	CCTCT	2	10	236620	236629	0 %	40 %	0 %	60 %	118430998
5022	NC_000854	ATC	2	6	236638	236643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118430998
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5028	NC_000854	TAG	2	6	236817	236822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118430998
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5115	NC_000854	ACG	2	6	242303	242308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118431002
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5120	NC_000854	GTC	2	6	242752	242757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118431002
5121	NC_000854	GGGCT	2	10	242822	242831	0 %	20 %	60 %	20 %	118431002
5122	NC_000854	CAA	2	6	242919	242924	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	118431002
5123	NC_000854	CAA	2	6	242979	242984	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	118431002
5124	NC_000854	GCC	2	6	243005	243010	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118431002
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5148	NC_000854	TCC	2	6	244387	244392	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118431003
5149	NC_000854	GTA	2	6	244431	244436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118431003
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5154	NC_000854	GGA	2	6	244796	244801	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118431004
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5242	NC_000854	AGA	2	6	248354	248359	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118431006
5243	NC_000854	CTG	2	6	248365	248370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118431006
5244	NC_000854	GCC	2	6	248398	248403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118431006
5245	NC_000854	GCA	2	6	248426	248431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118431006
5246	NC_000854	GTCT	2	8	248448	248455	0 %	50 %	25 %	25 %	118431006
5247	NC_000854	CTA	2	6	248504	248509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118431006
5248	NC_000854	CCAGC	2	10	248521	248530	20 %	0 %	20 %	60 %	118431006
5249	NC_000854	AGA	2	6	248549	248554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118431006
5250	NC_000854	TCC	2	6	248563	248568	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118431006
5251	NC_000854	CCT	2	6	248595	248600	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118431006
5252	NC_000854	TCC	2	6	248656	248661	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118431006
5253	NC_000854	ATC	2	6	248664	248669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118431006
5254	NC_000854	GAC	2	6	248711	248716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118431006
5255	NC_000854	CCT	2	6	248804	248809	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118431006
5256	NC_000854	CGC	2	6	248921	248926	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118431006
5257	NC_000854	GCC	2	6	248954	248959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118431006
5258	NC_000854	TA	5	10	248960	248969	50 %	50 %	0 %	0 %	118431006
5259	NC_000854	CT	4	8	249012	249019	0 %	50 %	0 %	50 %	118431006
5260	NC_000854	CTT	2	6	249147	249152	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118431006
5261	NC_000854	AGG	2	6	249235	249240	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118431006
5262	NC_000854	CCA	2	6	249249	249254	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	118431006
5263	NC_000854	GGC	2	6	249286	249291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5264	NC_000854	TTA	2	6	249370	249375	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5265	NC_000854	ATA	2	6	249385	249390	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5266	NC_000854	CCAT	2	8	249410	249417	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5267	NC_000854	TCA	2	6	249468	249473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118431007
5268	NC_000854	GCC	2	6	249537	249542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118431007
5269	NC_000854	TCC	2	6	249543	249548	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118431007
5270	NC_000854	CTC	2	6	249557	249562	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118431007
5271	NC_000854	CTC	2	6	249571	249576	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118431007
5272	NC_000854	C	6	6	249677	249682	0 %	0 %	0 %	100 %	118431007
5273	NC_000854	ACT	2	6	249718	249723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118431007
5274	NC_000854	AGG	2	6	249735	249740	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118431007
5275	NC_000854	CCG	2	6	249792	249797	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118431007
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5277	NC_000854	TA	3	6	249868	249873	50 %	50 %	0 %	0 %	118431007
5278	NC_000854	TGCA	2	8	249886	249893	25 %	25 %	25 %	25 %	118431007
5279	NC_000854	CCTC	2	8	250029	250036	0 %	25 %	0 %	75 %	118431007
5280	NC_000854	CAA	2	6	250054	250059	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	118431007
5281	NC_000854	CTC	3	9	250063	250071	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118431007
5282	NC_000854	AGC	2	6	250156	250161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118431007
5283	NC_000854	CGC	2	6	250207	250212	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118431007
5284	NC_000854	CTC	2	6	250232	250237	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118431007
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5286	NC_000854	CGA	2	6	250335	250340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118431007
5287	NC_000854	GGGT	2	8	250528	250535	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
5288	NC_000854	GCT	2	6	250581	250586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5289	NC_000854	CTC	2	6	250622	250627	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14600647
5290	NC_000854	CCT	2	6	250630	250635	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14600647
5291	NC_000854	CGC	2	6	250663	250668	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	14600647
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5293	NC_000854	G	6	6	250708	250713	0 %	0 %	100 %	0 %	14600647
5294	NC_000854	TTA	2	6	250714	250719	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14600647
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5296	NC_000854	TCC	2	6	250800	250805	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14600647
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5300	NC_000854	GTCCAC	2	12	250947	250958	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	14600647
5301	NC_000854	CTG	2	6	250975	250980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	14600647
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5303	NC_000854	TGC	2	6	251013	251018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	14600647
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5305	NC_000854	TCC	2	6	251077	251082	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14600647
5306	NC_000854	GCC	2	6	251199	251204	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118431008
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5308	NC_000854	GAA	2	6	251223	251228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118431008
5309	NC_000854	CCAC	2	8	251327	251334	25 %	0 %	0 %	75 %	118431008
5310	NC_000854	TCC	2	6	251363	251368	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118431008
5311	NC_000854	GAG	2	6	251379	251384	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118431008
5312	NC_000854	CT	3	6	251396	251401	0 %	50 %	0 %	50 %	118431008
5313	NC_000854	CCT	3	9	251493	251501	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118431008
5314	NC_000854	CGGG	2	8	251534	251541	0 %	0 %	75 %	25 %	118431008
5315	NC_000854	AG	3	6	251576	251581	50 %	0 %	50 %	0 %	118431008
5316	NC_000854	AC	4	8	251587	251594	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5317	NC_000854	ACT	2	6	251603	251608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5318	NC_000854	AGGT	2	8	251698	251705	25 %	25 %	50 %	0 %	14600650
5319	NC_000854	CGC	2	6	251897	251902	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	14600650
5320	NC_000854	TAT	2	6	251940	251945	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14600650
5321	NC_000854	TTG	2	6	252031	252036	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	14600650
5322	NC_000854	CAC	4	12	252039	252050	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	14600650
5323	NC_000854	TTC	2	6	252068	252073	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14600650
5324	NC_000854	CGTC	2	8	252077	252084	0 %	25 %	25 %	50 %	14600650
5325	NC_000854	TCT	2	6	252086	252091	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14600650
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5330	NC_000854	CT	4	8	252273	252280	0 %	50 %	0 %	50 %	14600650
5331	NC_000854	C	6	6	252294	252299	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5332	NC_000854	ACCTCT	2	12	252326	252337	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	14600651
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5334	NC_000854	CTTT	2	8	252390	252397	0 %	75 %	0 %	25 %	14600651
5335	NC_000854	CTC	2	6	252421	252426	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14600651
5336	NC_000854	TCC	2	6	252485	252490	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14600651
5337	NC_000854	GCG	2	6	252602	252607	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	14600651
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5340	NC_000854	CTG	2	6	252767	252772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	14600651
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5344	NC_000854	TC	3	6	252914	252919	0 %	50 %	0 %	50 %	14600651
5345	NC_000854	CCT	2	6	252970	252975	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5346	NC_000854	TCT	2	6	252989	252994	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14600652
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5348	NC_000854	CTT	2	6	253135	253140	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14600652
5349	NC_000854	CATC	2	8	253158	253165	25 %	25 %	0 %	50 %	14600652
5350	NC_000854	TC	3	6	253164	253169	0 %	50 %	0 %	50 %	14600652
5351	NC_000854	CCT	2	6	253221	253226	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14600652
5352	NC_000854	CT	3	6	253356	253361	0 %	50 %	0 %	50 %	14600652
5353	NC_000854	CCT	2	6	253425	253430	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14600652
5354	NC_000854	CCT	2	6	253505	253510	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14600653
5355	NC_000854	CTT	2	6	253520	253525	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14600653
5356	NC_000854	AT	3	6	253548	253553	50 %	50 %	0 %	0 %	14600653
5357	NC_000854	CT	3	6	253563	253568	0 %	50 %	0 %	50 %	14600653
5358	NC_000854	GAA	2	6	253596	253601	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14600653
5359	NC_000854	G	6	6	253677	253682	0 %	0 %	100 %	0 %	14600653
5360	NC_000854	TTG	2	6	253707	253712	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	14600653
5361	NC_000854	TCC	2	6	253729	253734	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14600653
5362	NC_000854	CTC	2	6	253743	253748	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14600653
5363	NC_000854	GCC	2	6	253842	253847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	14600653
5364	NC_000854	TCC	2	6	253855	253860	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14600653
5365	NC_000854	CCT	2	6	253873	253878	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14600653
5366	NC_000854	CCTC	2	8	253917	253924	0 %	25 %	0 %	75 %	14600654
5367	NC_000854	TCC	2	6	253953	253958	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14600654
5368	NC_000854	TATCCT	2	12	253959	253970	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	14600654
5369	NC_000854	TCG	2	6	253977	253982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	14600654
5370	NC_000854	TC	3	6	254103	254108	0 %	50 %	0 %	50 %	14600654
5371	NC_000854	GCC	2	6	254197	254202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	14600654
5372	NC_000854	CCA	2	6	254247	254252	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	14600654
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5375	NC_000854	TAT	2	6	254298	254303	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14600654
5376	NC_000854	TGA	2	6	254313	254318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14600654
5377	NC_000854	CT	3	6	254424	254429	0 %	50 %	0 %	50 %	14600654
5378	NC_000854	AGGAG	2	10	254555	254564	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
5379	NC_000854	GGAGT	2	10	254565	254574	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
5380	NC_000854	TAG	2	6	254576	254581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118431009
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5394	NC_000854	CCT	2	6	255244	255249	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118431011
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5397	NC_000854	CT	3	6	255278	255283	0 %	50 %	0 %	50 %	118431011
5398	NC_000854	CTC	2	6	255379	255384	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118431011
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5406	NC_000854	TTA	2	6	256001	256006	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118431012
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5410	NC_000854	TGT	2	6	256119	256124	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118431012
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5419	NC_000854	TGC	2	6	256470	256475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118431012
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5422	NC_000854	CCTG	2	8	256582	256589	0 %	25 %	25 %	50 %	14600658
5423	NC_000854	CTC	2	6	256595	256600	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14600658
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5425	NC_000854	TTCT	2	8	256610	256617	0 %	75 %	0 %	25 %	14600658
5426	NC_000854	TCG	2	6	256622	256627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	14600658
5427	NC_000854	TA	3	6	256717	256722	50 %	50 %	0 %	0 %	14600658
5428	NC_000854	CCT	2	6	256732	256737	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14600658
5429	NC_000854	CTC	2	6	256913	256918	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14600658
5430	NC_000854	CTC	2	6	256937	256942	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14600658
5431	NC_000854	C	6	6	256966	256971	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5432	NC_000854	CGG	2	6	257020	257025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	14600659
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5437	NC_000854	CTT	2	6	257198	257203	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14600659
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5442	NC_000854	CTT	4	12	257381	257392	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14600659
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5447	NC_000854	GTA	2	6	257570	257575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118431013
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5450	NC_000854	CAA	2	6	257623	257628	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	118431013
5451	NC_000854	AGC	2	6	257637	257642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118431013
5452	NC_000854	C	6	6	257644	257649	0 %	0 %	0 %	100 %	118431013
5453	NC_000854	CGTGC	2	10	257660	257669	0 %	20 %	40 %	40 %	118431013
5454	NC_000854	CCT	2	6	257928	257933	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14600661
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5456	NC_000854	GAGG	2	8	257962	257969	25 %	0 %	75 %	0 %	14600661
5457	NC_000854	TG	3	6	257976	257981	0 %	50 %	50 %	0 %	14600661
5458	NC_000854	GAG	2	6	258007	258012	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14600661
5459	NC_000854	TCC	2	6	258094	258099	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118431014
5460	NC_000854	CCTC	2	8	258103	258110	0 %	25 %	0 %	75 %	118431014
5461	NC_000854	AGG	2	6	258129	258134	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118431014
5462	NC_000854	TCT	2	6	258190	258195	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118431014
5463	NC_000854	CTC	2	6	258200	258205	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118431014
5464	NC_000854	CCT	2	6	258265	258270	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5465	NC_000854	CTC	2	6	258279	258284	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14600662
5466	NC_000854	TCC	2	6	258289	258294	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14600662
5467	NC_000854	CTC	2	6	258300	258305	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14600662
5468	NC_000854	GCC	2	6	258316	258321	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	14600662
5469	NC_000854	CT	3	6	258330	258335	0 %	50 %	0 %	50 %	14600662
5470	NC_000854	TCC	2	6	258352	258357	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14600662
5471	NC_000854	CT	3	6	258370	258375	0 %	50 %	0 %	50 %	14600662
5472	NC_000854	CTT	3	9	258410	258418	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14600662
5473	NC_000854	CGA	2	6	258521	258526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	14600662
5474	NC_000854	GCG	2	6	258661	258666	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	14600662
5475	NC_000854	CCT	2	6	258675	258680	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14600662
5476	NC_000854	CT	3	6	258694	258699	0 %	50 %	0 %	50 %	14600662
5477	NC_000854	GCT	2	6	258755	258760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	14600662
5478	NC_000854	CCT	2	6	258806	258811	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14600662
5479	NC_000854	CCT	2	6	258816	258821	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14600662
5480	NC_000854	TGG	2	6	258824	258829	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	14600662
5481	NC_000854	C	6	6	258830	258835	0 %	0 %	0 %	100 %	14600662
5482	NC_000854	TCC	2	6	258836	258841	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14600662
5483	NC_000854	TAT	2	6	258843	258848	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14600662
5484	NC_000854	TGTTA	2	10	258873	258882	20 %	60 %	20 %	0 %	14600662
5485	NC_000854	AAC	2	6	258900	258905	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	14600662
5486	NC_000854	CTG	2	6	258913	258918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	14600662
5487	NC_000854	AGCC	2	8	258942	258949	25 %	0 %	25 %	50 %	14600662
5488	NC_000854	AGC	2	6	259196	259201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	14600663
5489	NC_000854	CCT	2	6	259270	259275	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14600663
5490	NC_000854	CCTC	2	8	259314	259321	0 %	25 %	0 %	75 %	14600663
5491	NC_000854	CAC	2	6	259493	259498	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5492	NC_000854	GCT	2	6	259536	259541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118431015
5493	NC_000854	TGC	2	6	259570	259575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118431015
5494	NC_000854	GTC	2	6	259585	259590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118431015
5495	NC_000854	ATC	2	6	259618	259623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118431015
5496	NC_000854	CCA	2	6	259682	259687	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	118431015
5497	NC_000854	CTC	2	6	259752	259757	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118431015
5498	NC_000854	CCT	3	9	259761	259769	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118431015
5499	NC_000854	AGC	3	9	259786	259794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118431015
5500	NC_000854	CTG	2	6	259797	259802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118431015

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